Okulumuz 4+4+4 yeni eğitim sistemi kapsamında 2012-2013 eğitim öğretim yılında ilk defa Düzce Anadolu İmam-Hatip Lisesi bünyesinde 5. sınıfa öğrenci alarak eğitim öğretim faaliyetine başlamıştır. 2013-2014 eğitim öğretim yılında Karaca Mahallesinde bulunan 100. Yıl Ortaokulu binasında geçici olarak Mehmet Zahid Kevseri İmam-Hatip Ortaokulu adıyla yeni açılan müstakil imam-hatip ortaokuluna öğrenci kaydına başlamış ve o yıl hem Düzce Anadolu İmam-Hatip Lİsesi bünyesindeki İmam-hatip Ortaokulu ve hem de 100. Yıl Ortaokulu binasında hizmet veren Mehmet Zahid Kevseri İmam-Hatip Ortaokulu 5. sınıf öğrenci kaydı alarak farklı iki okul olarak eğitim öğretim faaliyetlerine devam etmişlerdir. Bu arada Düzce Adliye binası ile Düzce Anadolu İmam-Hatip Lisesi binası arasındaki arsada okulumuzun hizmet binasının temeli atılmış ve inşaatı devam etmiştir.2014-2015 eğitim öğretim yılına gelindiğinde Düzce Anadolu İmam-Hatip Lisesi bünyesinde bulunan İmam-Hatip Ortaokuluna yer yokluğu nedeniyle yeni kayıt öğrenci alınmamış olup, sadece 100. Yıl Ortaokulu binasında geçici olarak hizmet veren Mehmet Zahid Kevseri İmam-Hatip Ortaokulu´na öğrenci kaydı yapılmıştır. 2014-2015 eğitim öğretim yılı birinci dönemi ortasında Düzce Anadolu İmam-Hatip Lisesi bünyesinde bulunan İmam-Hatip Ortaokulu öğrencilerinin tamamının kayıtları Mehmet Zahid Kevseri İmam-Hatip Ortaokulu´na nakledilerek tek bir okul haline dönüştürülmüştür. 2014-2015 eğtim öğretim yılını Düzce Anadolu İmam-Hatip Lisesi ve 100.Yıl Ortaokulu binalarında tamamlayan okulumuz, 2015-2016 eğitim öğretim yılında yeni yapılan hizmet binasına taşınmış ve halen yeni binasında eğitim öğretim faaliyetlerine devam etmektedir.